Soutenance de thèse de Mme Martha Nigg

06 juillet 2017 9 h

Lieu : Pavillon Charles-Eugène-Marchand, salle 1210

Titre de la thèse

Analyses transcriptomiques du dimorphisme levure-mycélium chez le champignon phytopathogène Ophiostoma novo-ulmi

Résumé

L’analyse de données de transcriptomique par le biais du séquençage d’ARN messagers (RNAseq) offre une perspective globale de la régulation de l’expression génique au cours d’un évènement biologique. Dans cette thèse, nous avons exploité cette technique dans le but de comprendre les mécanismes moléculaires qui régulent la transition morphologique réversible levure-mycélium qui est une caractéristique souvent liée au pouvoir pathogène chez les champignons. Dans un premier temps, par le biais de comparaisons de données de transcriptomique entre sept espèces fongiques dimorphiques, nous avons observé une certaine conservation des processus biologiques associés au changement de morphologie chez des champignons issus de branches très éloignées de l’arbre phylogénétique fongique. Dans un second temps, nous nous sommes concentrée sur notre modèle d’étude principal, Ophiostoma novo-ulmi, le champignon pathogène responsable de la maladie hollandaise de l’orme. Par l’analyse comparée des gènes exprimés en phases levure et mycélienne, nous avons défini les facteurs moléculaires qui sont spécifiques à chacune des phases chez O. novo-ulmi. Par la suite, nous avons affiné notre étude en nous focalisant sur l’évènement de transition levure-mycélium de afin déterminer les gènes dont l’expression était modulée au cours du temps dans le processus de changement morphologique. Finalement, dans le but d’évaluer plus précisément le niveau de conservation des processus biologiques liés au dimorphisme chez des espèces non-modèles éloignées, nous avons comparé la régulation de l’expression génique au niveau des gènes orthologues entre O. novo-ulmi et l’espèce basidiomycète, P. flocculosa. 

Informations supplémentaires :

Membres du jury

Président

M. Jean-Claude Ruel
Université Laval, Faculté de foresterie, de géographie et de géomatique

Examinateurs

M. Louis Bernier, directeur de recherche
Université Laval, Faculté de foresterie, de géographie et de géomatique

M. Richard Bélanger, examinateur
Faculté des sciences de l'agriculture et de l'alimentation

M. Danny Rioux, examinateur externe
Service canadien des forêts

M. Gregory Gauthier, examinateur externe
University of Wisconsin, School of Medicine and Public Health