John Mackay

John Mackay

Professeur à l’Université d’Oxford, Angleterre

Coordonnées

Department of Plant Sciences, University of Oxford
john.mackay@plants.ox.ac.uk

Formation

  • Postdoctorat en biotechnologie forestière, 1997 (North Carolina State University)
  • Ph.D. en génétique, 1996 (North Carolina State University)
  • Maîtrise en sciences forestières, 1988 (Université Laval)
  • B.Sc. aménagement des ressources forestières, 1986 (Université Laval)

Champs d'expertise

  • Chimie du bois
  • Génétique et amélioration des arbres
  • Génomique forestière
  • Physique du bois
  • Physiologie végétale

Centres et groupes de recherche

Projets de recherche actifs en date du 2014-10-15 auxquels le chercheur participe

Projets de recherche terminés entre le 2013-04-01 et le 2014-10-14

  • Marqueurs moléculaires et méthodes d'évaluation rapide de la qualité du bois chez l'épinette: applications aux populations d'amélioration génétique du Québec et analyse des retombées, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Recherche en partenariat sur l'aménagement et l'environnement forestiers IV, du 2010-04-30 au 2013-05-01
  • Réseau Ligniculture Québec: Continuité des travaux R&D et transfert technologique, Subvention, Ministère des Ressources naturelles et de la Faune, du 2013-10-08 au 2014-03-31
  • Réseau Ligniculture Québec (RLQ), Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Projets Ad Hoc : PQ - Prompt Québec, du 2007-07-01 au 2013-06-30
  • Un séquenceur de table de nouvelle génération pour la génomique fonctionnelle, la génomique comparative et la biologie des systèmes, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions d'outils et d'instruments de recherche (OIR), du 2013-03-31 au 2014-03-30

Étudiant(e)s au doctorat

  • Dufils, Benjamin. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Évaluation de nouvelles méthodes de culture du peuplier visant a réduire les intrants et les émissions de gaz à effet de serre
  • Lamara, Mebarek. (Codirection) Doctorat en sciences forestières
    Marqueurs moléculaires et méthodes d'évaluation rapide de la qualité du bois chez l'épinette blanche
  • Mendez Espinoza, Claudia. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Genetics of spruce budworm resistance in Picea glauca: role of the PgBglu-1 gene
  • Sahli, Atef. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Structure et évolution des génomes de conifères
  • Sena, Juliana Stival. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Structure et évolution du génome chez les conifères

Référez-vous au site du Centre d'étude de la forêt pour la liste complète des publications de M. John Mackay.

Publications sélectionnées

  1. Bomal, C., Duval, I., Giguere, I., Fortin, E., Caron, S., Stewart, D., Boyle, B., Seguin, A. and MacKay, J. (2014) Opposite action of R2R3-MYBs from different subgroups on key genes of the shikimate and monolignol pathways in spruce. Journal of Experimental Botany, 65(2):495-508. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  2. Stival Sena, J., Giguere, I., Boyle, B., Rigault, P., Birol, I., Zuccolo, A., Ritland, K., Ritland, C., Bohlmann, J., Jones, S., Bousquet, J. and MacKay, J. (2014) Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size. BMC Plant Biology, 14(1):95. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  3. Duval, I., Lachance, D., Giguere, I., Bomal, C., Morency, M.-J., Pelletier, G., Boyle, B., MacKay, J. and Seguin, A. (2014) Large-scale screening of transcription factor-promoter interactions in spruce reveals a transcriptional network involved in vascular development. Journal of Experimental Botany, 65(9):2319-2333. (Résumé | EndNote | BibTeX)
  4. Beaulieu, J., Doerksen, T., Clement, S., MacKay, J. and Bousquet, J. (2014) Accuracy of genomic selection models in a large population of open-pollinated families in white spruce. Heredity, 113(4):343-352. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  5. Pavy, N., Gagnon, F., Rigault, P., Blais, S., Deschenes, A., Boyle, B., Pelgas, B., Deslauriers, M., Clement, S., Lavigne, P., Lamothe, M., Cooke, J.E., Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) Development of high-density SNP genotyping arrays for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeners. Molecular Ecology Resources, 13(2):324-336. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  6. Lenz, P., Auty, D., Achim, A., Beaulieu, J. and MacKay, J. (2013) Genetic Improvement of White Spruce Mechanical Wood Traits—Early Screening by Means of Acoustic Velocity. Forests, 4(3):575-594. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  7. Rutledge, R.G., Stewart, D., Caron, S., Overton, C., Boyle, B., MacKay, J. and Klimaszewska, K. (2013) Potential link between biotic defense activation and recalcitrance to induction of somatic embryogenesis in shoot primordia from adult trees of white spruce (Picea glauca). BMC Plant Biology, 13:116. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  8. Verta, J.-P., Landry, C.R. and MacKay, J. (2013) Are long-lived trees poised for evolutionary change? Single locus effects in the evolution of gene expression networks in spruce. Molecular Ecology, 22(9):2369-2379. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  9. Birol, I., Raymond, A., Jackman, S. D., Pleasance, S., Coope, R., Taylor, G. A., Yuen, M.M.S, Keeling, C. I., Brand, D., Vandervalk, B. P., Kirk, H., Pandoh, P., Moore, R.A., Zhao, Y., Mungall, A. J., Jaquish, B., Yanchuk, A., Ritland, C., Boyle, B., Bousquet, J., Ritland, K., MacKay, J., Bohlmann, J. and Jones, S.J.M. (2013) Assembling the 20 Gb white spruce (Picea glauca) genome from whole-genome shotgun sequencing data. Bioinformatics, 29(12):1492-1497. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  10. Pavy, N., Deschênes, A., Blais, S., Lavigne, P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) The Landscape of Nucleotide Polymorphism among 13,500 Genes of the Conifer Picea glauca, Relationships with Functions, and Comparison with Medicago truncatula. Genome Biology and Evolution, 5(10):1910-1925. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
Expertises

Champs d'expertise

  • Chimie du bois
  • Génétique et amélioration des arbres
  • Génomique forestière
  • Physique du bois
  • Physiologie végétale

Centres et groupes de recherche

Projets de recherche

Projets de recherche actifs en date du 2014-10-15 auxquels le chercheur participe

Projets de recherche terminés entre le 2013-04-01 et le 2014-10-14

  • Marqueurs moléculaires et méthodes d'évaluation rapide de la qualité du bois chez l'épinette: applications aux populations d'amélioration génétique du Québec et analyse des retombées, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Recherche en partenariat sur l'aménagement et l'environnement forestiers IV, du 2010-04-30 au 2013-05-01
  • Réseau Ligniculture Québec: Continuité des travaux R&D et transfert technologique, Subvention, Ministère des Ressources naturelles et de la Faune, du 2013-10-08 au 2014-03-31
  • Réseau Ligniculture Québec (RLQ), Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Projets Ad Hoc : PQ - Prompt Québec, du 2007-07-01 au 2013-06-30
  • Un séquenceur de table de nouvelle génération pour la génomique fonctionnelle, la génomique comparative et la biologie des systèmes, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions d'outils et d'instruments de recherche (OIR), du 2013-03-31 au 2014-03-30
Étudiants

Étudiant(e)s au doctorat

  • Dufils, Benjamin. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Évaluation de nouvelles méthodes de culture du peuplier visant a réduire les intrants et les émissions de gaz à effet de serre
  • Lamara, Mebarek. (Codirection) Doctorat en sciences forestières
    Marqueurs moléculaires et méthodes d'évaluation rapide de la qualité du bois chez l'épinette blanche
  • Mendez Espinoza, Claudia. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Genetics of spruce budworm resistance in Picea glauca: role of the PgBglu-1 gene
  • Sahli, Atef. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Structure et évolution des génomes de conifères
  • Sena, Juliana Stival. (Codirection) Doctorat en sciences forestières 
    Structure et évolution du génome chez les conifères
Publications

Référez-vous au site du Centre d'étude de la forêt pour la liste complète des publications de M. John Mackay.

Publications sélectionnées

  1. Bomal, C., Duval, I., Giguere, I., Fortin, E., Caron, S., Stewart, D., Boyle, B., Seguin, A. and MacKay, J. (2014) Opposite action of R2R3-MYBs from different subgroups on key genes of the shikimate and monolignol pathways in spruce. Journal of Experimental Botany, 65(2):495-508. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  2. Stival Sena, J., Giguere, I., Boyle, B., Rigault, P., Birol, I., Zuccolo, A., Ritland, K., Ritland, C., Bohlmann, J., Jones, S., Bousquet, J. and MacKay, J. (2014) Evolution of gene structure in the conifer Picea glauca: a comparative analysis of the impact of intron size. BMC Plant Biology, 14(1):95. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  3. Duval, I., Lachance, D., Giguere, I., Bomal, C., Morency, M.-J., Pelletier, G., Boyle, B., MacKay, J. and Seguin, A. (2014) Large-scale screening of transcription factor-promoter interactions in spruce reveals a transcriptional network involved in vascular development. Journal of Experimental Botany, 65(9):2319-2333. (Résumé | EndNote | BibTeX)
  4. Beaulieu, J., Doerksen, T., Clement, S., MacKay, J. and Bousquet, J. (2014) Accuracy of genomic selection models in a large population of open-pollinated families in white spruce. Heredity, 113(4):343-352. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  5. Pavy, N., Gagnon, F., Rigault, P., Blais, S., Deschenes, A., Boyle, B., Pelgas, B., Deslauriers, M., Clement, S., Lavigne, P., Lamothe, M., Cooke, J.E., Jaramillo-Correa, J.P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) Development of high-density SNP genotyping arrays for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeners. Molecular Ecology Resources, 13(2):324-336. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  6. Lenz, P., Auty, D., Achim, A., Beaulieu, J. and MacKay, J. (2013) Genetic Improvement of White Spruce Mechanical Wood Traits—Early Screening by Means of Acoustic Velocity. Forests, 4(3):575-594. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  7. Rutledge, R.G., Stewart, D., Caron, S., Overton, C., Boyle, B., MacKay, J. and Klimaszewska, K. (2013) Potential link between biotic defense activation and recalcitrance to induction of somatic embryogenesis in shoot primordia from adult trees of white spruce (Picea glauca). BMC Plant Biology, 13:116. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  8. Verta, J.-P., Landry, C.R. and MacKay, J. (2013) Are long-lived trees poised for evolutionary change? Single locus effects in the evolution of gene expression networks in spruce. Molecular Ecology, 22(9):2369-2379. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  9. Birol, I., Raymond, A., Jackman, S. D., Pleasance, S., Coope, R., Taylor, G. A., Yuen, M.M.S, Keeling, C. I., Brand, D., Vandervalk, B. P., Kirk, H., Pandoh, P., Moore, R.A., Zhao, Y., Mungall, A. J., Jaquish, B., Yanchuk, A., Ritland, C., Boyle, B., Bousquet, J., Ritland, K., MacKay, J., Bohlmann, J. and Jones, S.J.M. (2013) Assembling the 20 Gb white spruce (Picea glauca) genome from whole-genome shotgun sequencing data. Bioinformatics, 29(12):1492-1497. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)
  10. Pavy, N., Deschênes, A., Blais, S., Lavigne, P., Beaulieu, J., Isabel, N., MacKay, J. and Bousquet, J. (2013) The Landscape of Nucleotide Polymorphism among 13,500 Genes of the Conifer Picea glauca, Relationships with Functions, and Comparison with Medicago truncatula. Genome Biology and Evolution, 5(10):1910-1925. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX)